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海绵从它们过滤的水中收集企鹅,海豹和鱼类DNA
2019-06-04    阅读量:31599    新闻来源:互联网     |  投稿

就像人们在我们居住的地方消灭DNA一样,水栖动物会在水柱中消灭DNA。在6月3日发表在“当代生物学”杂志上的一篇论文中,科学家们报告说,每天可能过滤10,000升水的海绵在过滤饲料时会捕获组织的DNA。这项概念验证研究认可来自南极和地中海的海绵中的鱼类,海豹和企鹅DNA,证明海绵可用于观察生物多样性stylechina.com


“海绵是理想的采样单位,因为你可以在任何地方和每个水生栖息地找到它们,包括淡水,”索尔福德大学的海洋生态学家和居民遗传学家Stefano Mariani说。“此外,他们不是非常有选择性的过滤器,他们不会逃跑,他们不会受到采样的伤害 - 你可以抓住一块,它们将很好地再生。”


此外,作者发现海绵DNA的存在并没有侵入其确定其组织内捕获的不同物种的DNA的能力。相反,他们发现通过利用特定的DNA引物,这是一种探测特定生物DNA的简短核酸序列,它们可以选择性地扩增脊椎动物DNA,同时避免放大海绵DNA本身。


使用这种与元组编码相结合的方法,将组织模式中的DNA杂乱类型划分为可区分的物种特定的堆,Mariani和他的工作人员已经确定了31个分类群。大多数情况下,所识别的物种都是鱼类,但是来自南极洲的一种海绵图案包括来自威德尔海豹和颊带企鹅的DNA。该模式后来被认为位于企鹅繁殖地的近海。“这是一个非常令人兴奋的发现,也很有意义,”玛丽安尼说,“因为企鹅会在水中进出,吃饭,游泳和偷窥。”


目前,正在开发具有大量水样采集能力的机器,以允许科学家从水中模拟DNA,但作者认为使用纯采样器可能只是效率很高。由于存在于水中的DNA被过度稀释,因此必须深入过滤 - 但Mariani警告说,过滤过程会带来DNA污染的危害。此外,保存水样会危害DNA的降解。尽管如此,海绵组织已经过滤掉了水,除了污染的威胁之外,还大大降低了每个处理时间。


此外,将机器带入某些地区是不可能的,也可能对脆弱的生态系统造成太大破坏。“如果你想研究莫桑比克红树林中濒临灭绝的锯鲆或海牛,那么就不能用大型机器人去那里。你必须采用非常低技术的方法,”Mariani说。


继续前进,作者希望研究不同动物表现为DNA采样器的能力,在开放水域中,海绵对于取样而言并不常见或无法到达。玛丽安尼意味着不同的生物类似于果冻鱼或鲑鱼,它们还可以通过水柱漂浮水,也可以在开阔的海洋中进一步获取。


最终,作者的目标是增强环境DNA的收集方式,以便能够更高地监测可能不适合不同策略的区域的生物多样性。尽管如此,确定海绵在捕获空间的生物多样性方面是否比预先存在的策略更实用,还需要进行额外的分析,但是作者说这篇文章是回答这个问题的第一步。“我希望这种方法能证明自己有用,”玛丽安尼说。“这是典型的环境友好型生物多样性评估工具。”


作者承认英国NERC拨款的协助。


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