最新的SARS-CoV-2 CDC核酸检测试剂盒在最佳的州公共卫生实验室Sin Hang博士中产生30%的假阳性结果和20%的假阴性结果Lee在发表于日本在线期刊《国际老年医学与康复杂志》(http://www.int-soc-clin-geriat.com/info/wp-content/uploads/2020)的同行评审文章中报道/03/Dr.-Lees-paper-on-testing-for-SARS-CoV-2.pdf),于2020年7月17日。
米尔福德分子诊断实验室主任,医学博士Sin Hang Lee,本文的作者(http://www.dnalymetest.com/images/IJGeriatRehabLee_on_SARSCoV2_test.pdf),重新测试了康涅狄格州公共部门提供的20个参考样品。根据发表的文章,健康微生物学实验室部门得出了这个结论。根据参考文献,这些参考样品由国家微生物实验室使用CDC测试盒进行测试,并用作标准参考,以指导当地实验室针对可疑的COVID-19患者的临床样品开发自己的SARS-CoV-2测试。标题为“通过常规的嵌套式RT-PCR然后进行DNA测序测试细胞成分中的SARS-CoV-2”的文章。
Lee博士是第一位开发用于测试SARS-CoV-2基因组RNA协议的方法的科学家,该协议可以测试细胞成分而不是拭子冲洗液的无细胞液体样品。
Lee博士解释说:“病毒必须在活细胞中生长和复制,并且一个受感染的细胞可能贡献了数千个要测试的病毒基因组当量拷贝。”
美国食品药品监督管理局(FDA)要求在紧急使用授权(EUA)下进行SARS-CoV-2分子诊断测试的要求中,实验室开发的测试必须与参考样品达成95%的阳性和阴性协议)。但是FDA还指出:“可以使用其他EUA RT-PCR分析和/或Sanger测序来研究错误的结果。” Lee博士说,这表明Sanger测序是解决基于核酸的不一致测试结果的事实上的金标准。
使用Sanger测序作为分子验证的工具,发现康涅狄格州实验室提供的两个假阴性样品之一包含一个突变体,该突变体在N基因中插入了一个新的单核苷酸A,并带有一个野生型父母SARS-CoV -2,表明新开发的突变体及其亲本病毒可以共同感染同一宿主,如本文发表的该N基因序列所示。
Lee博士在文章中报道,发现这9个阳性SARS-CoV-2阳性分离物中的一个属于最近发现的突变体,该突变体首先从2020年3月17日在纽约州采集的标本中分离出来。
“其居民和鼻子和喉咙外科部门活跃的医院中,COVID-19死亡人数异常高的长期护理机构可能需要为SARS-CoV-2安装基于Sanger测序的极其灵敏和高度准确的测试,保护居民,患者和员工。”李博士说。
根据Lee博士的说法,该手稿经过5位审稿人和2个期刊编辑委员会的同行评审,然后才最终通过开放评审程序接受出版。
Lee博士提供了一项方案,以重新检验疗养院已故居民的呼吸道拭子样本的残留,这些死亡对SARS-CoV-2造成了极高的死亡人数,他的方案旨在调查假检验结果与高比率之间的可能联系如新闻媒体所广泛报道的那样,这些机构中COVID-19的死亡人数是多少。鼓励有兴趣的各方联系Kevin Moore。