过去十年见证了生命科学行业令人眼花缭乱的增长。医学和生物学在过去几年中取得的不断进步导致下一代测序 (NGS) 数据和数据集的惊人增长。与去年同期相比,几个国家的基因组数据呈爆炸式增长,迫切需要高性能计算 (HPC) 环境:用于测序数据的公共档案每年翻一番。
多年来,生物信息学服务市场获得了显着的发展势头。基因组研究人员经常沉浸在超大规模数据集中,为多组学数据分析管道提供了广阔的空间。
包括云平台在内的计算科学的进步扩展了能力
主要包括协议、算法和多组学数据分析管道的一系列生物信息学服务塑造了市场需求。服务提供商扩展了计算资源和人类专业知识,以满足来自测序和基因分型的广泛需求。他们正在与客户签订合同,通过各种微阵列平台满足后者的全基因组数据分析。
计算科学和硬件系统的众多进步丰富了生物信息学服务市场的格局,尤其是计算资源。各种基于云的服务,尤其是 SaaS,实验室生物学家对生物信息学服务的需求是支持前景的关键趋势。
按需计算云平台越来越受欢迎,尤其适用于这些海量数据的下游分析。在用于跨云平台共享数据的方法中进行了改进。云计算本身的能力已经有了巨大的增长。半导体技术的进步使服务提供商能够扩展台式下一代测序解决方案的产品组合。
生物信息学中并行技术的集成带来巨大挑战
HPC 基础架构经历了多次更改,可以轻松地将不同的平台集成到一个工作流程中。在这方面,并行技术的集成带来了相当大的挑战,因此对于服务于生命科学行业需求的服务提供商和技术公司来说也是一个机会。因此,未来的产品开发可能会集中在这方面。值得注意的是,软件开发人员正在为此不懈努力。此外,成功关注下一代测序数据质量控制的服务提供商在市场上获得了显着的竞争优势。
最近,现有参与者尤其是服务提供商的重点已转移到满足定制生物信息学管道的需求上。这在基因本体论和癌症研究中很明显。
此类功能在以前的版本中已经存在,通常作为用户定义的管道功能,但最近专用资源变得很普遍。研究的可重复性是另一个关键方面,对生物信息学服务提供商的客户来说意义重大。这些进步必须满足客户端和服务器端的需求,并进一步强调 HPC 的简化。另一个趋势是对开源软件的需求不断增长,这将刺激生物信息学服务市场对工具和微阵列的采用。
需要让高通量 NGS 平台更加经济实惠
高通量 NGS 平台已经开始吸引财务状况良好的客户的注意力。这些在理解新兴疾病生物学的各个方面显示出令人难以置信的前景。特别是,生物信息学服务市场中的此类解决方案在个体患者的组学分析中显示出巨大的前景。这个方向的一个重要发展是整合了不需要生物学家和医学研究人员高级软件专业知识的功能。为此,服务提供商寻求先进的基于网络的分析环境。越来越多地使用测序平台进行从头测序是另一个趋势。
但是,需要使其更适合小型实验室。考虑到个性化医疗需求的趋势在全球掀起波澜,这可能会变得比以往任何时候都更加重要。生物信息学工具法规的进步推动了这种发展。一个典型的例子是欧盟。这种发展也将在世界其他地区积聚势头。
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